Воспроизводимость по умолчанию
Каждый прогон сохраняет версию модели, окружение, входы и контрольные суммы. Результат, который нельзя повторить, в исследовательском отчёте бесполезен.
Вычислительный дизайн белков с воспроизводимым следом каждого расчёта. Исследователь запускает сценарий из браузера или терминала, среда фиксирует версии моделей, входные данные и параметры, а на выходе собирает документ с отобранными кандидатами.
Типовые задачи дизайна оформлены как готовые сценарии запуска с понятными параметрами — не нужно собирать команду по англоязычной документации.
Браузерная форма для исследователя и терминальный запуск для автоматизации. Одна и та же конфигурация даёт один и тот же результат.
Результаты прогона проходят через настраиваемые фильтры и ранжирование, а не выгружаются «как есть» на разбор вручную.
По итогам прогона собирается отчёт: что запускали, на чём, с какими параметрами и какие кандидаты отобраны. В таком виде расчёт передают в лабораторию.
Версии моделей, окружение, входные данные и контрольные суммы сохраняются вместе с результатом: прогон можно повторить и через полгода.
Набор моделей и весов подключается как внешний слой: обновление моделей не ломает прикладную часть и упрощает лицензионный учёт.
Каждый прогон сохраняет версию модели, окружение, входы и контрольные суммы. Результат, который нельзя повторить, в исследовательском отчёте бесполезен.
Открытые модели белкового дизайна закрыты русскоязычными сценариями и формами запуска. Порог входа для исследователя — часы, а не недели.
Модели и веса подключаются внешним слоем, поэтому лицензионный и патентный статус каждого источника учитывается явно, а не растворяется в коде приложения.
Среда честно называет результат гипотезой: отобранные кандидаты идут на экспериментальную проверку, а не в заявления об эффективности и безопасности.
Установка среды с русскоязычными сценариями запуска, браузерным интерфейсом и сборкой расчётных документов.
Развёртывание в закрытом контуре с разграничением доступа, учётом прогонов и архивом артефактов расчётов.
Настройка критериев отбора и форм расчётного отчёта под конкретную программу разработки, обучение исследователей.
Разбираем, какие расчётные сценарии нужны программе разработки и по каким критериям вы отбираете кандидатов.
1 неделяСтавим среду в ваш контур, подключаем набор моделей с проверенным лицензионным статусом, настраиваем формы отчётов.
2–4 неделиЗапускаем первые сценарии вместе с вашей группой и доводим расчётный документ до формата, пригодного для эксперимента.
постоянноПлатформа расчётов. Результат прогона — расчётные кандидаты и гипотезы; эффективность, безопасность и пригодность к производству доказываются экспериментом и последующими исследованиями.
Открытый набор моделей белкового дизайна, подключённый внешним слоем. Лицензионный и патентный статус моделей, весов и данных проверяется до установки — это отдельный этап внедрения.
Нет. Среда рассчитана на работу в контуре организации: входные данные, прогоны и артефакты остаются внутри.
Да, ради этого среда и сохраняет версии моделей, окружение, входы и контрольные суммы вместе с результатом.
Возьмём сценарий из вашей программы разработки и пройдём его целиком: запуск, отбор кандидатов и расчётный документ для лаборатории.
Или свяжитесь напрямую: info@tochka-yasnosty.ru · +7 993 418-20-90